MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC03 chromosome

Total Repeats: 50349

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016787	CTG	2	6	83	88	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250169
2	NC_016787	AAC	2	6	89	94	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376250169
3	NC_016787	CGT	2	6	223	228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250169
4	NC_016787	CAC	2	6	325	330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376250169
5	NC_016787	ACT	2	6	347	352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376250169
6	NC_016787	ACA	2	6	404	409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376250169
7	NC_016787	CGA	2	6	420	425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376250169
8	NC_016787	CAC	2	6	448	453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376250169
9	NC_016787	CAGCA	2	10	488	497	40 %	0 %	20 %	40 %	376250169
10	NC_016787	TCG	3	9	522	530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250169
11	NC_016787	AGC	3	9	539	547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376250169
12	NC_016787	GAA	2	6	565	570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376250169
13	NC_016787	CGC	2	6	586	591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376250169
14	NC_016787	GA	3	6	594	599	50 %	0 %	50 %	0 %	376250169
15	NC_016787	CAA	2	6	678	683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376250169
16	NC_016787	CGG	2	6	695	700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376250169
17	NC_016787	GC	4	8	724	731	0 %	0 %	50 %	50 %	376250169
18	NC_016787	TTC	2	6	843	848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376250169
19	NC_016787	TGA	2	6	885	890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376250169
20	NC_016787	CGA	2	6	942	947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376250169
21	NC_016787	TTC	2	6	988	993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376250169
22	NC_016787	GCA	2	6	1011	1016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376250169
23	NC_016787	CCA	2	6	1051	1056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376250169
24	NC_016787	CCA	2	6	1126	1131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376250169
25	NC_016787	CGG	2	6	1172	1177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376250169
26	NC_016787	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376250169
27	NC_016787	GCAG	2	8	1347	1354	25 %	0 %	50 %	25 %	376250169
28	NC_016787	CGG	2	6	1367	1372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376250169
29	NC_016787	CTG	2	6	1391	1396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250169
30	NC_016787	TGG	2	6	1530	1535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376250169
31	NC_016787	ACG	2	6	1546	1551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376250169
32	NC_016787	CAG	2	6	1618	1623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376250169
33	NC_016787	GCA	2	6	1629	1634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376250169
34	NC_016787	GGT	2	6	1699	1704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016787	ACA	2	6	1717	1722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016787	GT	3	6	1787	1792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016787	GCC	2	6	2002	2007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_016787	AGCGA	2	10	2132	2141	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_016787	AAG	2	6	2223	2228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016787	CTC	3	9	2245	2253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_016787	GATC	2	8	2270	2277	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016787	GAG	2	6	2283	2288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016787	GAC	2	6	2334	2339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376250170
44	NC_016787	CGGTG	2	10	2345	2354	0 %	20 %	60 %	20 %	376250170
45	NC_016787	CCA	2	6	2377	2382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376250170
46	NC_016787	GC	3	6	2402	2407	0 %	0 %	50 %	50 %	376250170
47	NC_016787	TCA	2	6	2413	2418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376250170
48	NC_016787	CCG	2	6	2419	2424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376250170
49	NC_016787	GCCA	2	8	2497	2504	25 %	0 %	25 %	50 %	376250170
50	NC_016787	CAT	2	6	2540	2545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376250170
51	NC_016787	TCG	2	6	2578	2583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250170
52	NC_016787	TTC	2	6	2612	2617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376250170
53	NC_016787	CGA	2	6	2645	2650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376250170
54	NC_016787	TGC	2	6	2719	2724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250170
55	NC_016787	TGC	2	6	2729	2734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250170
56	NC_016787	ACG	2	6	2840	2845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376250170
57	NC_016787	GCT	2	6	2885	2890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250170
58	NC_016787	GAA	2	6	2900	2905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376250170
59	NC_016787	ACC	2	6	3027	3032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376250170
60	NC_016787	GCT	2	6	3071	3076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250170
61	NC_016787	CCG	2	6	3134	3139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376250170
62	NC_016787	CGA	2	6	3191	3196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376250170
63	NC_016787	TC	3	6	3203	3208	0 %	50 %	0 %	50 %	376250170
64	NC_016787	TGG	2	6	3212	3217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376250170
65	NC_016787	AAGC	2	8	3406	3413	50 %	0 %	25 %	25 %	376250170
66	NC_016787	ACCT	2	8	3450	3457	25 %	25 %	0 %	50 %	376250170
67	NC_016787	CT	3	6	3491	3496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016787	TTG	2	6	3606	3611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376250171
69	NC_016787	GT	3	6	3681	3686	0 %	50 %	50 %	0 %	376250171
70	NC_016787	GT	3	6	3729	3734	0 %	50 %	50 %	0 %	376250171
71	NC_016787	CTG	2	6	3776	3781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250171
72	NC_016787	GCT	2	6	3844	3849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250171
73	NC_016787	GTT	2	6	3854	3859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376250171
74	NC_016787	GTG	2	6	3900	3905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376250171
75	NC_016787	TGC	2	6	3993	3998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250171
76	NC_016787	CAG	2	6	4023	4028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376250171
77	NC_016787	TGC	2	6	4030	4035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250171
78	NC_016787	CGT	2	6	4040	4045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250171
79	NC_016787	GAT	2	6	4058	4063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376250171
80	NC_016787	TG	3	6	4084	4089	0 %	50 %	50 %	0 %	376250171
81	NC_016787	TGG	2	6	4111	4116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376250171
82	NC_016787	TCAT	2	8	4122	4129	25 %	50 %	0 %	25 %	376250171
83	NC_016787	ATG	2	6	4170	4175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376250171
84	NC_016787	GAA	2	6	4268	4273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376250171
85	NC_016787	TGCT	2	8	4287	4294	0 %	50 %	25 %	25 %	376250171
86	NC_016787	G	6	6	4329	4334	0 %	0 %	100 %	0 %	376250171
87	NC_016787	TGG	2	6	4341	4346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376250171
88	NC_016787	TGA	2	6	4357	4362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376250171
89	NC_016787	TGC	2	6	4461	4466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250171
90	NC_016787	ATG	2	6	4470	4475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376250171
91	NC_016787	CGT	2	6	4529	4534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250171
92	NC_016787	TCA	2	6	4575	4580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376250171
93	NC_016787	GGTG	2	8	4588	4595	0 %	25 %	75 %	0 %	376250171
94	NC_016787	CGG	2	6	4623	4628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376250171
95	NC_016787	CGC	2	6	4687	4692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376250171
96	NC_016787	CTG	2	6	4729	4734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250172
97	NC_016787	AGG	2	6	4753	4758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376250172
98	NC_016787	A	6	6	4761	4766	100 %	0 %	0 %	0 %	376250172
99	NC_016787	ACG	2	6	4831	4836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376250172
100	NC_016787	AAC	2	6	4855	4860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376250172
101	NC_016787	GTC	2	6	4885	4890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250172
102	NC_016787	GGC	3	9	4891	4899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376250172
103	NC_016787	GAT	2	6	5001	5006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376250172
104	NC_016787	TGG	2	6	5008	5013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376250172
105	NC_016787	TGC	2	6	5024	5029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250172
106	NC_016787	ATG	2	6	5109	5114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376250172
107	NC_016787	ATT	2	6	5121	5126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376250172
108	NC_016787	ATC	2	6	5160	5165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376250172
109	NC_016787	GGC	2	6	5203	5208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376250172
110	NC_016787	CAC	2	6	5487	5492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376250173
111	NC_016787	CGA	2	6	5522	5527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376250173
112	NC_016787	CGG	2	6	5576	5581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376250173
113	NC_016787	TGG	2	6	5711	5716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376250173
114	NC_016787	CGT	2	6	5738	5743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250173
115	NC_016787	ACC	2	6	5865	5870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376250173
116	NC_016787	ACC	2	6	5907	5912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376250173
117	NC_016787	CTT	2	6	5954	5959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376250173
118	NC_016787	GAA	2	6	6033	6038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376250173
119	NC_016787	TCGATG	2	12	6073	6084	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	376250173
120	NC_016787	CTG	2	6	6106	6111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250173
121	NC_016787	GAA	3	9	6128	6136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376250173
122	NC_016787	TCT	2	6	6142	6147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376250173
123	NC_016787	CCACC	2	10	6203	6212	20 %	0 %	0 %	80 %	376250173
124	NC_016787	ATC	2	6	6213	6218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376250173
125	NC_016787	AAC	2	6	6270	6275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376250173
126	NC_016787	TGA	2	6	6370	6375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376250173
127	NC_016787	GCT	2	6	6398	6403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250173
128	NC_016787	AAGGAA	2	12	6405	6416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376250173
129	NC_016787	GAC	2	6	6432	6437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376250173
130	NC_016787	CCG	2	6	6454	6459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376250173
131	NC_016787	ATC	2	6	6606	6611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376250173
132	NC_016787	GGC	2	6	6644	6649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376250173
133	NC_016787	GC	3	6	6657	6662	0 %	0 %	50 %	50 %	376250173
134	NC_016787	CGT	2	6	6672	6677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250173
135	NC_016787	CGG	2	6	6695	6700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376250173
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248	NC_016787	ATC	2	6	11723	11728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
249	NC_016787	GCA	2	6	11732	11737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_016787	TAT	2	6	11753	11758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_016787	CCA	2	6	11868	11873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
252	NC_016787	T	6	6	11988	11993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_016787	T	6	6	12007	12012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_016787	CCT	2	6	12014	12019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
255	NC_016787	CG	3	6	12060	12065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
256	NC_016787	TTC	2	6	12227	12232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376250179
257	NC_016787	GC	3	6	12237	12242	0 %	0 %	50 %	50 %	376250179
258	NC_016787	ATG	2	6	12351	12356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376250179
259	NC_016787	GTC	2	6	12446	12451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250179
260	NC_016787	GAG	2	6	12461	12466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376250179
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390	NC_016787	GCA	2	6	18949	18954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376250183
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392	NC_016787	TG	3	6	19237	19242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
393	NC_016787	T	6	6	19246	19251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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